O Τομέας Oικολογίας καλύπτει τη Δομή, τη Δυναμική και τη Διαχείριση
Oικοσυστημάτων και την Προστασία του Περιβάλλοντος. Περιλαμβάνει το Εργαστήριο Oικολογίας που εξυπηρετεί τις εκπαιδευτικές και ερευνητικές ανάγκες στο εξής γνωστικό αντικείμενο: “Μελέτη των λειτουργικών σχέσεων των οργανισμών μεταξύ των και προς το περιβάλλον” (Π.Δ. 389/8-6-76, ΦΕΚ 140/9-6-76, τεύχος ΑΔ).