Βιοπληροφορική και βιοποικιλότητα φυτικών οργανισμών: • Eξερεύνηση της άγνωστης βιοποικιλότητας (μορφολογικής, γενετική, μεταβολιτών) φυτικών μικροοργανισμών και χαρτογράφηση της ποικιλότητάς τους με κλασική και μεταγονιδιωματική ανάλυση. • Φυλογένεση προκαρυωτικών και ευκαρυωτικών φωτοσυνθετικών οργανισμών. • Ποικιλότητα βιοδραστικών ενώσεων (πεπτίδια, αλκαλοειδή) σε στελέχη και φυσικούς πληθυσμούς κυανοβακτηρίων και ιστούς υδρόβιων ζωικών οργανισμών. Επιδράσεις σε ανώτερα φυτά και κυτταροκαλλιέργειες. • Πληροφορική της βιοποικιλότητας (Biodiversity informatics). Βάσεις δεδομένων βιοποικιλότητας.