Βιοπληροφορική και βιοποικιλότητα φυτικών οργανισμών: Eξερεύνηση της άγνωστης βιοποικιλότητας (μορφολογικής, γενετική, μεταβολιτών) φυτικών μικροοργανισμών και χαρτογράφηση της βιοποικιλότητας των φυτικών μικροοργανισμών με κλασική και μεταγονιδιωματική ανάλυση. Φυλογένεση προκαρυωτικών και ευκαρυωτικών φωτοσυνθετικών οργανισμών. Ποικιλότητα βιοδραστικών ενώσεων (πεπτίδια, αλκαλοειδή) σε στελέχη και φυσικούς πληθυσμούς κυανοβακτηρίων και ιστούς υδρόβιων ζωικών οργανισμών. Επιδράσεις σε ανώτερα φυτά και κυτταροκαλλιέργειες. Πληροφορική της βιοποικιλότητας (Biodiversity informatics). Ανάπτυξη βάσεων δεδομένων βιοποικιλότητας.