Καταγραφή της ποικιλότητας των ζωοπλαγκτικών οργανισμών (τροχοφόρων, κλαδοκερωτών και κωπήποδων) σε υδάτινα συστήματα εσωτερικών και παράκτιων υδάτων, την διερεύνηση των προτύπων ταξινομικής διακριτότητας καθώς και τα βιογεωγραφικά πρότυπα ζωοπλαγκτικών οργανισμών στα υδάτινα συστήματα, στην βιολογία και οικολογία ζωοπλαγκτικών οργανισμών λιμνών, ποταμών, παράκτιων θαλασσών εστιάζοντας στις αλληλεπιδράσεις του τροφικού πλέγματος σε μεσογειακά οικοσυστήματα εσωτερικών υδάτων, στην πολυφασική ταξινόμηση ζωοπλαγκτικών οργανισμών (μορφολογία, οικολογία, φυλογένεση), την χρήση των ζωοπλαγκτικών οργανισμών στην εκτίμηση της οικολογικής ποιότητας των υδάτινων συστημάτων και την αποκατάσταση λιμναίων συστημάτων.